Tekoälyyhtiö Anthropic väittää, että sen Claude-kielimalli on löytänyt bakteereja infentoivista viruksista aiemmin kuvailemattoman entsyymijärjestelmän saatuaan yhtiön tutkijoilta vain yleiset ohjeet. Entsyymigeenin vieressä sijaitsee pitkä DNA-toistojakso, joka muistuttaa CRISPR-järjestelmää. Kukaan ei vielä tiedä, mitä järjestelmä todellisuudessa tekee, ei edes Anthropic.
Anthropic kirjoittaa syyskuun 23. päivän tiedotteessaan, että järjestelmä on nimetty ART:ksi, mikä on lyhenne sanoista array-associated reverse transcriptases. Löytö esitellään ensimmäisenä julkisena tuloksena uudelta biotieteiden tutkimusryhmältä, jota varten yhtiö on rakentanut oman molekyylibiologian laboratorion Kalifornian Bay Arealle.
Kyseessä ei ole uusi geeninmuokkaustyökalu. Anthropic itse myöntää, että järjestelmän toiminta on tuntematon ja että kokeet jatkuvat. Yhtiön toiveet lepäävät siinä, että ART:lla on yhdistelmä ominaisuuksia, joita on tähän mennessä löydetty vain muutamista muista järjestelmistä. Kaikki ne voidaan ohjelmoida leikkaamaan, kopioimaan tai liittämään DNA:ta.
Avaa julkaisu X:ssä
950 agenttia 21 tunnissa
Yhtiön mukaan tutkijoiden rooli rajoittui alkuohjeisiin ja laboratoriotyöhön. Clauden tehtävänä oli etsiä suuresta DNA-sekvenssien tietokannasta kiinnostavia uusia esimerkkejä käänteiskopioijista eli RT-entsyymeistä. Nämä entsyymit kopioivat RNA:ta DNA:ksi.
Malli otti tämän jälkeen vallan. Noin 950 Claude-agenttia työskenteli 21 tuntia ja käytti 210 miljoonaa tokenia eli tekstiyksikköä, joita kielimallit käsittelevät. Agentit keräsivät yli 200 000 RT-entsyymiä, tunnistivat 3 500 uutta mahdollista järjestelmää ja karsivat ne 20 lupaavimpaan. Jokaisesta ehdokkaasta kirjoitettiin raportti, jotta ihmiset voisivat lukea ja arvioida ne.
Anthropicin mukaan tällainen läpikäynti voi viedä kokeneelta tutkijalta viikoista kuukausiin.
Etsinnän aikana yksi agentti huomasi epätavallisen RT-perheen. Geenin vieressä olevassa raa'assa DNA-sekvenssissä se havaitsi toistuvan kuvion. Anthropicin kertomuksen mukaan agentti kutsui sekvenssiä ”spektaakkelimaiseksi” ja pohti, voisiko kyseessä olla CRISPR-tyyppinen toistojaksojen sarja.
Niin sanotun jumbo-faagin RT-entsyymi tunnettiin jo aiemmista tutkimuksista. Anthropic antaa Claudelle kunnian siitä, että se yhdisti kyseisen entsyymin viereiseen DNA-toistojaksoon ja toisen proteiinin geeniin, jonka toiminta on tuntematon. Yhdessä nämä kolme komponenttia muodostavat järjestelmän, jota yhtiö kutsuu nimellä ART.
Lyhyitä RNA-molekyylejä, mutta tuntematon toiminta
Ensimmäisissä laboratoriotutkimuksissa toistojakso tuotti useita erillisiä lyhyitä RNA-molekyylejä Anthropicin mukaan. Se on varhainen havainto, joka tekee CRISPR-vertailusta kiinnostavan, mutta se ei osoita, mitä ART tekee tai voidaanko järjestelmää käyttää geeninmuokkaukseen.
CRISPR-edelläkävijä Feng Zhang, MIT:n ja Broad-instituutin professori, on lukenut tutkijoiden esijulkaisun. Anthropicin sitaatin mukaan hän kutsuu käänteiskopioijiin liittyvien RNA-toistojaksojen löytämistä aidosti kiinnostavaksi ja jatkotutkimuksen arvoiseksi. Hän kuvailee työtä jännittäväksi esimerkiksi siitä, miten tekoälyagentit voivat edistää biologisia löytöjä, ja toivoo useampien tutkijoiden tutkivan, miten tekoäly voi tukea heidän tutkimustaan.
Ihmiset suorittavat käytännön laboratoriotyön, yhtiö sanoo. Anthropic kuvailee työtä tutkimukseksi bioturvallisuustasoilla BSL-1 ja BSL-2 ja sanoo, ettei laboratoriossa käsitellä taudinaiheuttajia, jotka kykenevät tarttumaan ihmisiin.
Tutkijat raportoivat löydöksistään esijulkaisussa. Seuraava vaihe on kokeet, jotka voisivat osoittaa, miten ART toimii. Tähän mennessä tekoälyagentit ovat tunnistaneet mahdollisen uuden järjestelmän – eivät vahvistaneet, mitä se tekee.
